Die Verwaltung der Autonomen Region teilen sich der Volksrat und der Militär- und Verwaltungsausschuss. 

Während der Volksrat aus Vertretern des Volkes Wongdongs besteht, unter dem Vorsitz Seiner Heiligkeit des Tulku Rinpoches, ist der Militär- und Verwaltungsausschuss eine Abordnung tchinoischer Politiker und Armeeangehöriger, die das Volk von Wongdong beim Aufbau eines freien Staates auf unbestimmte Zeit unterstützt. Die Mitglieder des Ausschusses werden vom tchinosischen Staatsrat bestimmt. Zur steht er unter der Leitung des Generalleutnants Wu Li.

Die Verwaltung tagt in Wongdong-Stadt.

S.H. Tulku Rinpoche		Generalleutnant Wu Li